73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1106 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1106  transposon transposase  100 
 
 		 549 aa  1132    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.718118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1321  IS605 family transposase OrfB  40 
 
 		 542 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00289042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1807  IS605 family transposase OrfB  31.97 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0265  transposase, IS605 OrfB family  32.29 
 
 		 504 aa  206  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0217662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1910  hypothetical protein  32.65 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1738  transposase, IS605 OrfB family  31.77 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000991726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2559  transposase, IS605 OrfB family  30.08 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2061  transposase, IS605 OrfB family  29.54 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2656  transposase, IS605 OrfB family  25.66 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0457316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1791  transposase, IS605 OrfB family  28.13 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5073  transposase, IS605 OrfB family  24.94 
 
 		 497 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1071  transposase, putative  24.12 
 
 		 478 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2322  transposase  21.94 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0427  transposase, IS605 OrfB family  25.34 
 
 		 560 aa  90.9  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000019568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1427  transposase, IS605 OrfB family  27.35 
 
 		 562 aa  90.5  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.884594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0588  transposase  21.56 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0025  IS605 family transposase OrfB  24.4 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0400359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0954  transposase, IS605 OrfB family  26.8 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0044  transposase, IS605 OrfB family  26.55 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0131962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1106  transposase, IS605 OrfB family  27.44 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000302235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0786  transposase  25.93 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0816314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1869  transposase, IS605 OrfB family  24.21 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000405396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0863  transposase, IS605 OrfB family  26.8 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1151  transposase, IS605 OrfB family  23.98 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1774  transposase, IS605 OrfB family  27.79 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.918709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1896  transposase, IS605 OrfB family  26.03 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1605  transposase, IS605 OrfB family  28.46 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.908581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5171  transposase, IS605 family, OrfA  25.06 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0620  transposase, IS605 family, OrfA  24.64 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0478  transposase, IS605 OrfB family  27.52 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1622  transposase, IS605 OrfB family  28.3 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3097  transposase, IS605 family, OrfB  24.4 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0853  transposase, IS605 OrfB family  26.78 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5164  transposase, IS605 family, OrfA  25.06 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1928  transposase  25.62 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00442004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2110  transposase  25.62 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0863  transposase  25.62 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.330971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0076  transposase  26.15 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0465  transposase, IS605 OrfB family  27.72 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.220677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4903  transposase  24.93 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0066  transposase, IS605 OrfB family  22.69 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000182083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1746  IS605 family transposase OrfB  24.63 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5071  IS605 family transposase OrfB  25.15 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0982  transposase, IS605 family, OrfB  25.15 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26018e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2876  IS605 family transposase OrfB  24.27 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3091  IS605 family transposase OrfB  24.27 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1630  IS605 family transposase OrfA/OrfB  25.29 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0633106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1075  transposase, IS605 family, OrfA  25 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1832  transposase, IS605 family, OrfA  24.93 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1652  IS605 family transposase OrfB  24.71 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1783  IS605 family transposase OrfB  24.71 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0725  transposase, IS605 OrfB family  26.97 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000155555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1839  transposase  27.03 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.670681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0327  transposase, IS605 OrfB family  27.33 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00373732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0092  transposase  29.89 
 
 		 545 aa  67  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00157706  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1206  transposase  23.69 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000960806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0946  transposase  26.13 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0520  transposase, IS605 OrfB family  27.33 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000180512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1174  transposase  28.41 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1114  transposase, IS605 OrfB family  25.51 
 
 		 531 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0342  transposase  28.74 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000508394  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1586  transposase  26.94 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0359  transposase, IS605 OrfB family  25.83 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0954  transposase, IS605 OrfB family  26.23 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3231  hypothetical protein  25.53 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1279  transposase, IS605 OrfB family  24.7 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0237  transposase  30.06 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.696075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0619  transposase, IS605 OrfB family  24.07 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1448  transposase  29.3 
 
 		 530 aa  54.7  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00728617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0564  transposase  25.55 
 
 		 527 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316031 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2161  hypothetical protein  24.74 
 
 		 493 aa  50.8  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00252617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1143  transposase, IS605 OrfB family  22.86 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1166  hypothetical protein  24.34 
 
 		 404 aa  47  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.321618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>