1552 genes were found for organism Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 16    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Maeo_0001  CDS  NC_009635  196  1440  1245  hypothetical protein  YP_001324206  hitchhiker  1.75712e-05  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0002  CDS  NC_009635  1476  2579  1104  hypothetical protein  YP_001324207  decreased coverage  1.0754e-05  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0003  CDS  NC_009635  2672  3625  954  magnesium and cobalt transport protein CorA  YP_001324208  hitchhiker  5.48112e-06  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0004  CDS  NC_009635  3705  3977  273  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  YP_001324209  hitchhiker  0.000181188  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0005  CDS  NC_009635  4296  5723  1428  ADP-specific phosphofructokinase  YP_001324210  normal  0.100171  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0006  CDS  NC_009635  5810  7114  1305  glucose-6-phosphate isomerase  YP_001324211  normal  0.341166  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0007  CDS  NC_009635  7231  8811  1581  glycosyl transferase group 1  YP_001324212  normal  0.482024  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0008  CDS  NC_009635  9171  10343  1173  glycosyl transferase group 1  YP_001324213  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0009  CDS  NC_009635  10383  10601  219  hypothetical protein  YP_001324214  normal  0.419938  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0010  CDS  NC_009635  10806  12689  1884  glycoside hydrolase 15-related  YP_001324215  normal  0.148558  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0011  CDS  NC_009635  12767  14509  1743  Alpha-amylase  YP_001324216  normal  0.890558  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0012  CDS  NC_009635  14521  15204  684  GTP-binding protein  YP_001324217  normal  0.750735  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0013  CDS  NC_009635  15586  16107  522  50S ribosomal protein L10e  YP_001324218  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0014  CDS  NC_009635  16197  17474  1278  UbiD family decarboxylase  YP_001324219  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0015  CDS  NC_009635  17573  18211  639  precorrin-8X methylmutase  YP_001324220  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0016  CDS  NC_009635  18343  19161  819  hypothetical protein  YP_001324221  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0017  CDS  NC_009635  19421  19747  327  hypothetical protein  YP_001324222  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0018  CDS  NC_009635  19798  20844  1047  hypothetical protein  YP_001324223  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0019  CDS  NC_009635  20867  21694  828  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001324224  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0020  CDS  NC_009635  21796  22842  1047  hypothetical protein  YP_001324225  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0021  CDS  NC_009635  22945  24129  1185  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001324226  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0022  CDS  NC_009635  24318  24509  192  hypothetical protein  YP_001324227  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0023  CDS  NC_009635  24552  24944  393  hypothetical protein  YP_001324228  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0024  CDS  NC_009635  25119  25490  372  hydrogenase nickel insertion protein HypA  YP_001324229  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0025  CDS  NC_009635  25552  26850  1299  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001324230  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0026  CDS  NC_009635  27044  29605  2562  DNA topoisomerase I  YP_001324231  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0027  CDS  NC_009635  29701  30714  1014  aIF-2BI family translation initiation factor  YP_001324232  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0028  CDS  NC_009635  30801  32117  1317  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001324233  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0029  CDS  NC_009635  32203  32505  303  hypothetical protein  YP_001324234  normal  0.150772  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0030  CDS  NC_009635  32749  34005  1257  histidyl-tRNA synthetase  YP_001324235  normal  0.289573  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0031  CDS  NC_009635  34085  34612  528  hypothetical protein  YP_001324236  normal  0.209371  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0032  CDS  NC_009635  34946  36265  1320  phosphomannomutase  YP_001324237  normal  0.457022  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0033  CDS  NC_009635  36500  37510  1011  adenylosuccinate synthetase  YP_001324238  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0034  CDS  NC_009635  37628  39772  2145  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  YP_001324239  normal  0.530674  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0035  CDS  NC_009635  39805  40473  669  metallophosphoesterase  YP_001324240  normal  0.525214  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0036  CDS  NC_009635  40670  41659  990  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  YP_001324241  normal  0.384647  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0037  CDS  NC_009635  41741  42514  774  ExsB family protein  YP_001324242  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0038  CDS  NC_009635  42590  42886  297  transposase IS605 OrfB  YP_001324243  normal  0.612284  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0039    NC_009635  42862  43837  976      normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0040  CDS  NC_009635  44144  45280  1137  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_001324244  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0041  CDS  NC_009635  45578  46168  591  phospholipase D/transphosphatidylase  YP_001324245  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0042  CDS  NC_009635  46301  46768  468  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  YP_001324246  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0043  CDS  NC_009635  47244  48326  1083  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  YP_001324247  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0044  CDS  NC_009635  48701  50140  1440  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  YP_001324248  normal  0.328984  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0045  CDS  NC_009635  50244  52058  1815  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  YP_001324249  normal  0.308823  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0046  CDS  NC_009635  52089  53165  1077  radical SAM domain-containing protein  YP_001324250  normal  0.405197  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0047  CDS  NC_009635  53257  53703  447  heat shock protein Hsp20  YP_001324251  normal  0.333015  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0048  CDS  NC_009635  53921  55072  1152  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_001324252  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0049  CDS  NC_009635  55173  57080  1908  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001324253  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0050  CDS  NC_009635  57525  58178  654  proteasome endopeptidase complex  YP_001324254  normal  0.101333  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0051  CDS  NC_009635  58723  59115  393  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  YP_001324255  hitchhiker  0.00940201  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0052  CDS  NC_009635  59127  60278  1152  glutamyl-tRNA reductase  YP_001324256  normal  0.0279425  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0053  CDS  NC_009635  60356  61279  924  siroheme synthase  YP_001324257  hitchhiker  8.04715e-06  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0054  CDS  NC_009635  61344  62438  1095  glycosyl transferase group 1  YP_001324258  decreased coverage  2.26756e-07  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0055  CDS  NC_009635  62540  63148  609  hypothetical protein  YP_001324259  hitchhiker  4.97721e-05  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0056  CDS  NC_009635  63599  63922  324  RNA polymerase Rpb4  YP_001324260  normal  0.0452503  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0057  CDS  NC_009635  64090  64383  294  50S ribosomal protein L21e  YP_001324261  normal  0.280466  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0058  CDS  NC_009635  64813  65322  510  hypothetical protein  YP_001324262  normal  0.79573  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0059  CDS  NC_009635  65720  66028  309  ATPase A1A0 subunit H  YP_001324263  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0060  CDS  NC_009635  66069  68111  2043  V-type ATP synthase subunit I  YP_001324264  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0061  CDS  NC_009635  68189  68860  672  V-type ATP synthase subunit K  YP_001324265  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0062  CDS  NC_009635  68955  69566  612  H+transporting two-sector ATPase E subunit  YP_001324266  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0063  CDS  NC_009635  69599  70750  1152  V-type ATP synthase subunit C  YP_001324267  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0064  CDS  NC_009635  70834  71133  300  V-type ATP synthase subunit F  YP_001324268  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0065  CDS  NC_009635  71153  72913  1761  V-type ATP synthase subunit A  YP_001324269  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0066  CDS  NC_009635  73035  74429  1395  V-type ATP synthase subunit B  YP_001324270  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0067  CDS  NC_009635  74794  75432  639  V-type ATP synthase subunit D  YP_001324271  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0068  CDS  NC_009635  75573  75941  369  hypothetical protein  YP_001324272  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0069  CDS  NC_009635  76158  76550  393  hypothetical protein  YP_001324273  normal  0.595094  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0070  CDS  NC_009635  76813  77079  267  hypothetical protein  YP_001324274  normal  0.250069  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0071  CDS  NC_009635  77106  77801  696  RNA methyltransferase  YP_001324275  normal  0.17974  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0072  CDS  NC_009635  77915  78625  711  hypothetical protein  YP_001324276  normal  0.813723  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0073  CDS  NC_009635  78993  79652  660  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001324277  normal  0.690907  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0074  CDS  NC_009635  79672  79941  270  hypothetical protein  YP_001324278  normal  0.203707  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0075  CDS  NC_009635  79961  80701  741  uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_001324279  normal  0.29766  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0076  CDS  NC_009635  80928  81635  708  hypothetical protein  YP_001324280  normal  0.656256  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0077  CDS  NC_009635  81684  82061  378  hypothetical protein  YP_001324281  normal  0.715112  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0078  CDS  NC_009635  82208  82789  582  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001324282  normal  0.45768  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0079  CDS  NC_009635  82990  83184  195  ribosomal protein L24E  YP_001324283  normal  0.253901  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0080  CDS  NC_009635  83195  83422  228  30S ribosomal protein S28e  YP_001324284  normal  0.264632  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0081  CDS  NC_009635  83435  83788  354  50S ribosomal protein L7Ae  YP_001324285  normal  0.309731  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0082  CDS  NC_009635  84164  84748  585  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  YP_001324286  normal  0.474566  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0083  CDS  NC_009635  84860  86653  1794  amidohydrolase 3  YP_001324287  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0084  CDS  NC_009635  86655  87932  1278  formylmethanofuran dehydrogenase  YP_001324288  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0085  CDS  NC_009635  87937  89280  1344  molybdopterin oxidoreductase  YP_001324289  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0086  CDS  NC_009635  89713  90861  1149  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  YP_001324290  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0087  CDS  NC_009635  91149  92033  885  AIR synthase-like protein  YP_001324291  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0088  CDS  NC_009635  92424  93200  777  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  YP_001324292  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0089  CDS  NC_009635  93654  93956  303  cobalt transport protein CbiN  YP_001324293  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0090  CDS  NC_009635  93949  94581  633  cobalt transport protein CbiM  YP_001324294  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0091  CDS  NC_009635  94937  98734  3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001324295  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0092  CDS  NC_009635  98738  99487  750  regulatory protein ArsR  YP_001324296  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0093  CDS  NC_009635  99602  99841  240  MTH865-like family protein  YP_001324297  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0094  CDS  NC_009635  99904  100581  678  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001324298  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0095  CDS  NC_009635  100803  102767  1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001324299  normal  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0096  CDS  NC_009635  102864  104015  1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001324300  normal  0.337966  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0097  CDS  NC_009635  104119  105546  1428  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_001324301  normal  0.325648  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0098  CDS  NC_009635  105596  106498  903  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  YP_001324302  normal  0.412374  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0099  CDS  NC_009635  106564  106989  426  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  YP_001324303  normal  0.585779  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Maeo_0100  CDS  NC_009635  107410  108714  1305  molybdopterin oxidoreductase  YP_001324304  normal  0.193455  n/a    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 16    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>