4859 genes were found for organism Shewanella baltica OS195



Page 1 of 49    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sbal195_0001  CDS  NC_009997  382  1770  1389  chromosomal replication initiation protein  YP_001552443  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0002  CDS  NC_009997  1790  2890  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001552444  unclonable  6.34429e-07  hitchhiker  0.000143129  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0003  CDS  NC_009997  3092  4174  1083  recombination protein F  YP_001552445  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0004  CDS  NC_009997  4191  6608  2418  DNA gyrase, B subunit  YP_001552446  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0005  CDS  NC_009997  6721  7383  663  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001552447  normal  normal  0.0120161  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0006  CDS  NC_009997  7624  7926  303  monoheme cytochrome c  YP_001552448  normal  normal  0.0109329  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0007  CDS  NC_009997  7928  9154  1227  oxidoreductase molybdopterin binding  YP_001552449  normal  normal  0.01327  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0008  CDS  NC_009997  9154  9537  384  monoheme cytochrome c, putative  YP_001552450  normal  normal  0.0100224  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0009  CDS  NC_009997  9534  9869  336  monoheme cytochrome c  YP_001552451  normal  hitchhiker  0.00972927  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0010  CDS  NC_009997  9960  10880  921  urea amidolyase related protein  YP_001552452  normal  normal  0.0117619  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0011  CDS  NC_009997  11214  12254  1041  putative signal transduction protein  YP_001552453  normal  normal  0.0123691  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0012  CDS  NC_009997  12342  14411  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001552454  normal  normal  0.0151663  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0013  CDS  NC_009997  14422  15327  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_001552455  normal  hitchhiker  0.0098701  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0014  CDS  NC_009997  15445  16047  603  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001552456  normal  normal  0.0102454  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0015  CDS  NC_009997  16248  19436  3189  amidohydrolase  YP_001552457  normal  normal  0.0180602  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0016  CDS  NC_009997  19698  20144  447  hypothetical protein  YP_001552458  normal  normal  0.010551  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0017  CDS  NC_009997  20192  20437  246  sulfur transfer protein SirA  YP_001552459  normal  normal  0.0103959  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0018  CDS  NC_009997  20608  21771  1164  diguanylate cyclase  YP_001552460  normal  normal  0.0128135  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0019  CDS  NC_009997  22014  23177  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_001552461  normal  normal  0.0120161  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0020  CDS  NC_009997  23200  25350  2151  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_001552462  normal  0.0214886  normal  0.0135519  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0021  CDS  NC_009997  25841  27163  1323  proline dipeptidase  YP_001552463  normal  0.215078  normal  0.0114173  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0022  CDS  NC_009997  27191  27805  615  hypothetical protein  YP_001552464  normal  0.977624  normal  0.0115925  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0023  CDS  NC_009997  27883  29340  1458  TrkH family potassium uptake protein  YP_001552465  normal  0.211854  normal  0.0148489  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0024  CDS  NC_009997  29343  29867  525  protoporphyrinogen oxidase  YP_001552466  normal  0.0780321  normal  0.0115046  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0025  CDS  NC_009997  29931  30239  309  ArsR family transcriptional regulator  YP_001552467  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0026  CDS  NC_009997  30440  30991  552  protoporphyrinogen oxidase  YP_001552468  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0027  CDS  NC_009997  31062  32504  1443  TrkH family potassium uptake protein  YP_001552469  normal  normal  0.0149541  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0028  CDS  NC_009997  32525  33934  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001552470  normal  0.736909  normal  0.0141363  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0029  CDS  NC_009997  33950  35236  1287  sun protein  YP_001552471  normal  hitchhiker  0.00116562  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0030  CDS  NC_009997  35238  36194  957  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001552472  normal  hitchhiker  0.00109779  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0031  CDS  NC_009997  36203  36715  513  peptide deformylase  YP_001552473  normal  hitchhiker  0.000922598  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0032  CDS  NC_009997  36841  37971  1131  peptidoglycan-binding LysM  YP_001552474  normal  hitchhiker  0.00105156  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0033  CDS  NC_009997  38055  39071  1017  DNA protecting protein DprA  YP_001552475  normal  hitchhiker  0.000150023  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0034  CDS  NC_009997  39074  39547  474  hypothetical protein  YP_001552476  normal  hitchhiker  0.000131531  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0035  CDS  NC_009997  39661  40230  570  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_001552477  normal  0.99947  hitchhiker  0.000130269  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0036  CDS  NC_009997  40357  40923  567  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001552478  normal  hitchhiker  0.000121984  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0037  CDS  NC_009997  40886  41857  972  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001552479  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0038  CDS  NC_009997  41892  42329  438  globin  YP_001552480  normal  0.0612769  unclonable  9.27103e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0039  CDS  NC_009997  42483  43331  849  shikimate 5-dehydrogenase  YP_001552481  hitchhiker  3.17979e-06  unclonable  1.1065e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0040  CDS  NC_009997  43337  43612  276  hypothetical protein  YP_001552482  unclonable  2.15973e-08  unclonable  8.7148e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0041  CDS  NC_009997  43732  44280  549  carbonic anhydrase  YP_001552483  unclonable  4.11727e-08  unclonable  9.97439e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0042  CDS  NC_009997  50388  50576  189  hypothetical protein  YP_001552484  normal  0.0871438  unclonable  1.16494e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0043  CDS  NC_009997  50599  51054  456  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001552485  normal  0.0465453  unclonable  1.21376e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0044  CDS  NC_009997  51029  51784  756  protein of unknown function DUF610 YibQ  YP_001552486  normal  0.244614  unclonable  1.29234e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0045  CDS  NC_009997  51797  53002  1206  carboxyl-terminal protease  YP_001552487  normal  unclonable  1.44504e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0046  CDS  NC_009997  53035  54123  1089  peptidase M23B  YP_001552488  normal  unclonable  1.29234e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0047  CDS  NC_009997  54182  55726  1545  phosphoglyceromutase  YP_001552489  normal  unclonable  1.66466e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0048  CDS  NC_009997  55979  56428  450  rhodanese domain-containing protein  YP_001552490  normal  unclonable  1.23958e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0049  CDS  NC_009997  56724  57209  486  preprotein translocase subunit SecB  YP_001552491  normal  unclonable  1.26595e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0050  CDS  NC_009997  57214  58230  1017  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_001552492  normal  unclonable  1.47486e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0051  CDS  NC_009997  58424  59608  1185  hypothetical protein  YP_001552493  normal  unclonable  1.35975e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0052  CDS  NC_009997  60140  61207  1068  hypothetical protein  YP_001552494  normal  0.962002  unclonable  1.16494e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0053  CDS  NC_009997  61204  61872  669  hypothetical protein  YP_001552495  normal  unclonable  1.03945e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0054  CDS  NC_009997  62524  63885  1362  TrkH family potassium uptake protein  YP_001552496  normal  unclonable  1.22698e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0055  CDS  NC_009997  63887  64585  699  TrkA domain-containing protein  YP_001552497  normal  unclonable  8.27601e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0056  CDS  NC_009997  64633  65322  690  two component transcriptional regulator  YP_001552498  normal  unclonable  7.25059e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0057  CDS  NC_009997  65323  66369  1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001552499  normal  unclonable  6.3575e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0058  CDS  NC_009997  66640  67563  924  pirin domain-containing protein  YP_001552500  normal  unclonable  5.80792e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0059  CDS  NC_009997  68089  69762  1674  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_001552501  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0060  CDS  NC_009997  69756  70487  732  LytTR family two component transcriptional regulator  YP_001552502  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0061  CDS  NC_009997  70595  71839  1245  major facilitator transporter  YP_001552503  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0062  CDS  NC_009997  71974  72711  738  hypothetical protein  YP_001552504  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0063  CDS  NC_009997  72818  73312  495  NLP/P60 protein  YP_001552505  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0064  CDS  NC_009997  73371  74834  1464  major facilitator transporter  YP_001552506  normal  0.31678  hitchhiker  0.00316152  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0065  CDS  NC_009997  74927  75958  1032  LacI family transcription regulator  YP_001552507  normal  hitchhiker  0.00259026  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0066  CDS  NC_009997  76079  77557  1479  sucrose phosphorylase  YP_001552508  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0067  CDS  NC_009997  77829  79049  1221  major facilitator transporter  YP_001552509  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0068  CDS  NC_009997  79328  81724  2397  TonB-dependent receptor  YP_001552510  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0069  CDS  NC_009997  81844  82803  960  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001552511  normal  0.518061  normal  0.0251177  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0070  CDS  NC_009997  83059  83592  534  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_001552512  normal  normal  0.0229825  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0071  CDS  NC_009997  83800  89418  5619  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  YP_001552513  normal  normal  0.140868  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0072  CDS  NC_009997  89415  91697  2283  penicillin-binding protein 1C  YP_001552514  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0073  CDS  NC_009997  91719  91970  252  hypothetical protein  YP_001552515  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0074  CDS  NC_009997  92078  93217  1140  transport protein, putative  YP_001552516  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0075  CDS  NC_009997  93312  94046  735  ABC transporter related  YP_001552517  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0076  CDS  NC_009997  94050  95699  1650  TAP domain-containing protein  YP_001552518  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0077  CDS  NC_009997  95793  96164  372  GntR family transcriptional regulator  YP_001552519  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0078  CDS  NC_009997  96218  97081  864  ABC transporter related  YP_001552520  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0079  CDS  NC_009997  97078  98388  1311  hypothetical protein  YP_001552521  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0080  CDS  NC_009997  98517  100322  1806  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001552522  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0081  CDS  NC_009997  100466  102916  2451  MORN repeat-containing protein  YP_001552523  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0082  CDS  NC_009997  103044  103454  411  thioesterase superfamily protein  YP_001552524  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0083  CDS  NC_009997  103578  104126  549  HPP family protein?  YP_001552525  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0084  CDS  NC_009997  104193  104885  693  hypothetical protein  YP_001552526  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0085  CDS  NC_009997  104931  105197  267  hypothetical protein  YP_001552527  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0086  CDS  NC_009997  105260  105712  453  thioesterase superfamily protein  YP_001552528  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0087  CDS  NC_009997  105845  106240  396  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  YP_001552529  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0088  CDS  NC_009997  106244  106600  357  MerR family transcriptional regulator  YP_001552530  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0089  CDS  NC_009997  106794  107180  387  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001552531  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0090  CDS  NC_009997  107476  108558  1083  hypothetical protein  YP_001552532  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0091  CDS  NC_009997  108669  109349  681  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_001552533  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0092  CDS  NC_009997  109733  110167  435  hypothetical protein  YP_001552534  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0093  CDS  NC_009997  110264  111277  1014  hypothetical protein  YP_001552535  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0094  CDS  NC_009997  111613  111780  168  hypothetical protein  YP_001552536  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0095  CDS  NC_009997  111793  113616  1824  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_001552537  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0096  CDS  NC_009997  113834  114451  618  FMN-binding negative transcriptional regulator  YP_001552538  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0097  CDS  NC_009997  114808  116484  1677  endonuclease I  YP_001552539  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0098  CDS  NC_009997  117152  117712  561  MarR family transcriptional regulator  YP_001552540  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0099  CDS  NC_009997  117705  118463  759  siderophore-interacting protein  YP_001552541  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_0100  CDS  NC_009997  118575  119801  1227  imidazolonepropionase  YP_001552542  normal  normal  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 49    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>