16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2401 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  44.86 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  46.89 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4025  hypothetical protein  38.91 
 
 
391 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0085  hypothetical protein  37.94 
 
 
396 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3226  hypothetical protein  40.17 
 
 
327 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3755  hypothetical protein  32.35 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0094  hypothetical protein  34.52 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1475  hypothetical protein  31.82 
 
 
359 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000081449  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1585  hypothetical protein  30.88 
 
 
374 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1271  hypothetical protein  26.45 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26090  hypothetical protein  28.33 
 
 
336 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0444  hypothetical protein  25.15 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1799  hypothetical protein  25 
 
 
438 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0413  hypothetical protein  26.83 
 
 
341 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3427  hypothetical protein  25.19 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>