15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3427 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3427  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  889    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3310  hypothetical protein  56.71 
 
 
165 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3312  hypothetical protein  57.26 
 
 
130 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.167977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26090  hypothetical protein  25.93 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3309  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3727  hypothetical protein  30.14 
 
 
324 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3755  hypothetical protein  26.91 
 
 
427 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1475  hypothetical protein  27.74 
 
 
359 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000081449  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00260  hypothetical protein  23.42 
 
 
290 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  23.27 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0444  hypothetical protein  27.56 
 
 
329 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1799  hypothetical protein  25 
 
 
438 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  25.19 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3501  hypothetical protein  25.93 
 
 
331 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>