11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0444 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0444  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00260  hypothetical protein  48.34 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1799  hypothetical protein  42.09 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3727  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3501  hypothetical protein  38.36 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0413  hypothetical protein  26.48 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26090  hypothetical protein  25.51 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  25.15 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  25.43 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3427  hypothetical protein  27.56 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>