32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0366 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  98.11 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  83.02 
 
 		 106 aa  187  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  47.62 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  47.62 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  46.39 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  46.3 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  46.67 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  45.36 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  45.36 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  44.9 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  45.71 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  45.19 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  44.9 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  44.9 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  48.62 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  41.75 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  41.35 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  41.35 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  41.35 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  41.76 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  46.07 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  40.38 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  44.71 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  43.27 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  41.18 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2116  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>