31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  222  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  77.06 
 
 
122 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  77.06 
 
 
122 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  75.23 
 
 
108 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  76.36 
 
 
110 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  75.23 
 
 
108 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  76.36 
 
 
110 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  77.06 
 
 
107 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  73.64 
 
 
109 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  71.56 
 
 
108 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  70.64 
 
 
108 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  60 
 
 
109 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  58.49 
 
 
111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  53.47 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  46.6 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  46.6 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  48.04 
 
 
106 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  49 
 
 
106 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  49.48 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  49.48 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  49.48 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  45.83 
 
 
112 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  43.81 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  47.22 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  47.22 
 
 
106 aa  97.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  46.3 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  43.88 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  43.88 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  40.78 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>