31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4840 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  94.26 
 
 		 122 aa  239  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  97.22 
 
 		 108 aa  216  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  97.22 
 
 		 108 aa  216  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  90.74 
 
 		 107 aa  203  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  90.74 
 
 		 110 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  90.74 
 
 		 110 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  88.07 
 
 		 109 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  197  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  85.19 
 
 		 108 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  77.06 
 
 		 109 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  61.32 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  62.86 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  56.84 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  52.43 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  52.43 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  49.49 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  49.49 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  49.49 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  48.98 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  49.47 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  49.47 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  46 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  46.23 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  40.78 
 
 		 111 aa  97.1  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>