31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3777 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  90.74 
 
 		 122 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  87.96 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  87.96 
 
 		 110 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  87.96 
 
 		 110 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  85.19 
 
 		 108 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  87.16 
 
 		 109 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  84.26 
 
 		 108 aa  189  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  77.06 
 
 		 109 aa  171  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  65.45 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  60.95 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  57.89 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  54.9 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  54.9 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  49.5 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  49.5 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  48.51 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  48.51 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  48.51 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  46.08 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  46.73 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  46.73 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  43.81 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  42.06 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  45.87 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  44.76 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  45.19 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  44.66 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>