32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03549 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  83.02 
 
 
106 aa  187  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  82.08 
 
 
106 aa  184  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  45.54 
 
 
112 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  47.17 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  47.17 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  46.23 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  47.22 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  44.9 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  44.9 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  46.23 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  46.53 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  45.71 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  44.76 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  45.45 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  45.45 
 
 
110 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  45.45 
 
 
110 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  43.3 
 
 
106 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  43.69 
 
 
111 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  43.3 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  46.3 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  39.58 
 
 
106 aa  84.3  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  39.58 
 
 
106 aa  84.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  39.58 
 
 
106 aa  84.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  37.5 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2116  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>