31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3880 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  90.74 
 
 
108 aa  206  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  82.41 
 
 
106 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  83.18 
 
 
106 aa  183  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  78.5 
 
 
106 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  78.5 
 
 
106 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  78.5 
 
 
106 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  56.44 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  47.17 
 
 
122 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  48.48 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  45.28 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  45.87 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  44.34 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  43.56 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  45.63 
 
 
110 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  45.63 
 
 
110 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  42.72 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  44.66 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  44.66 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  44.12 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  41.75 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  40.66 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  40.86 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  40.86 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  40.66 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>