42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0054 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  707    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4841  hypothetical protein  47.31 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1905  Protein of unknown function DUF2183  46.65 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.607863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1698  hypothetical protein  47.7 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1700  hypothetical protein  48.36 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.174731  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00360  hypothetical protein  43.27 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.973936  normal  0.426065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0180  hypothetical protein  45.05 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01130  hypothetical protein  44.98 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3444  hypothetical protein  43.62 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07330  hypothetical protein  41.55 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1679  hypothetical protein  41.58 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237936  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04410  hypothetical protein  42.38 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2414  Protein of unknown function DUF2183  44.81 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0983  hypothetical protein  34.1 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0844103  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0301  hypothetical protein  34.68 
 
 		 490 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.362818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2101  hypothetical protein  38.91 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2843  hypothetical protein  35.07 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0459  hypothetical protein  34.75 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4397  Protein of unknown function DUF2183  38.82 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3789  hypothetical protein  33.74 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0844  hypothetical protein  31.16 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683683 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05945  hypothetical protein  27.71 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1861  hypothetical protein  26.29 
 
 		 320 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.669042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4889  Protein of unknown function DUF2183  29.28 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2742  hypothetical protein  26.16 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4838  Protein of unknown function DUF2183  29.3 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3155  Protein of unknown function DUF2183  27.92 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2956  hypothetical protein  30.17 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5817  hypothetical protein  27.39 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.281836  normal  0.0125997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0205  hypothetical protein  28.98 
 
 		 422 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3505  hypothetical protein  28.17 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.030263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1662  hypothetical protein  36.32 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0365  hypothetical protein  29.6 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4163  hypothetical protein  22.22 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  hitchhiker  0.000000516956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00605  actin cytoskeleton organization protein App1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10890)  28.57 
 
 		 1058 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0457  hypothetical protein  31.58 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 		 754 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 		 754 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 		 734 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10714  actin filament organization protein App1-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06650)  36.54 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70016  predicted protein  26.62 
 
 		 638 aa  71.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.165048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  41.82 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0324329  normal  0.231742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>