41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0301 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1004    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.362818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0983  hypothetical protein  60.47 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0844103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.973936  normal  0.426065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1905  Protein of unknown function DUF2183  35.84 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.607863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4841  hypothetical protein  31.19 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1700  hypothetical protein  33.89 
 
 		 347 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.174731  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01130  hypothetical protein  32.74 
 
 		 355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1698  hypothetical protein  34.34 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3444  hypothetical protein  32.88 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07330  hypothetical protein  40.78 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0180  hypothetical protein  29.23 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2101  hypothetical protein  34.83 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1679  hypothetical protein  30.3 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237936  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04410  hypothetical protein  30.07 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2414  Protein of unknown function DUF2183  36.55 
 
 		 352 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2843  hypothetical protein  39.08 
 
 		 338 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0459  hypothetical protein  34.6 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4889  Protein of unknown function DUF2183  34.47 
 
 		 382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2956  hypothetical protein  29.17 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4397  Protein of unknown function DUF2183  34.71 
 
 		 271 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3789  hypothetical protein  30.63 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1861  hypothetical protein  27.85 
 
 		 320 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.669042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0205  hypothetical protein  30.4 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5817  hypothetical protein  31.05 
 
 		 336 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.281836  normal  0.0125997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4163  hypothetical protein  32.99 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  hitchhiker  0.000000516956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2742  hypothetical protein  30.15 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4838  Protein of unknown function DUF2183  31.37 
 
 		 440 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05945  hypothetical protein  31.82 
 
 		 331 aa  91.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1662  hypothetical protein  36.09 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0844  hypothetical protein  30.98 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3155  Protein of unknown function DUF2183  29.94 
 
 		 357 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3505  hypothetical protein  27.8 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.030263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0365  hypothetical protein  31.7 
 
 		 377 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10714  actin filament organization protein App1-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06650)  30.23 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70016  predicted protein  26.32 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.165048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  28.25 
 
 		 754 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  28.25 
 
 		 754 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 734 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0457  hypothetical protein  28.93 
 
 		 319 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340218  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00605  actin cytoskeleton organization protein App1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10890)  22.22 
 
 		 1058 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>