40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4838 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4838  Protein of unknown function DUF2183  100 
 
 		 440 aa  872    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0205  hypothetical protein  46.34 
 
 		 422 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3789  hypothetical protein  45.33 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2956  hypothetical protein  40.69 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0844  hypothetical protein  45.67 
 
 		 429 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3505  hypothetical protein  40.54 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.030263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4889  Protein of unknown function DUF2183  36.01 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4397  Protein of unknown function DUF2183  44.87 
 
 		 271 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0459  hypothetical protein  34.65 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05945  hypothetical protein  30.84 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2843  hypothetical protein  35.05 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3444  hypothetical protein  30.97 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3155  Protein of unknown function DUF2183  29.65 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1905  Protein of unknown function DUF2183  31.14 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.607863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04410  hypothetical protein  30.82 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2414  Protein of unknown function DUF2183  32.08 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1861  hypothetical protein  27.15 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.669042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1662  hypothetical protein  34.75 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4163  hypothetical protein  27.91 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  hitchhiker  0.000000516956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1698  hypothetical protein  32.23 
 
 		 359 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5817  hypothetical protein  28.81 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.281836  normal  0.0125997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4841  hypothetical protein  28.75 
 
 		 360 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1700  hypothetical protein  30.58 
 
 		 347 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.174731  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2742  hypothetical protein  26.51 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1679  hypothetical protein  29.3 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237936  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07330  hypothetical protein  35.11 
 
 		 368 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0180  hypothetical protein  34.91 
 
 		 399 aa  97.8  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0054  hypothetical protein  29.3 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01130  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0365  hypothetical protein  32.02 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0301  hypothetical protein  28.85 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.362818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00360  hypothetical protein  33.5 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.973936  normal  0.426065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0983  hypothetical protein  31.76 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0844103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2101  hypothetical protein  30.88 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00605  actin cytoskeleton organization protein App1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10890)  30.77 
 
 		 1058 aa  83.2  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0457  hypothetical protein  22.19 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70016  predicted protein  26.26 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.165048  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10714  actin filament organization protein App1-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06650)  27.67 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32665  predicted protein  24.34 
 
 		 1149 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25.13 
 
 		 610 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0324329  normal  0.231742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>