41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05945 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05945  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4889  Protein of unknown function DUF2183  35.1 
 
 
382 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2843  hypothetical protein  32.22 
 
 
338 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0205  hypothetical protein  37.45 
 
 
422 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0844  hypothetical protein  32 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00683683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3789  hypothetical protein  40 
 
 
430 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4838  Protein of unknown function DUF2183  31.2 
 
 
440 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2956  hypothetical protein  32.42 
 
 
398 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4397  Protein of unknown function DUF2183  39.29 
 
 
271 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0459  hypothetical protein  32.02 
 
 
364 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3505  hypothetical protein  28.53 
 
 
432 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.030263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3155  Protein of unknown function DUF2183  34.19 
 
 
357 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1905  Protein of unknown function DUF2183  23.93 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.607863  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1861  hypothetical protein  31.27 
 
 
320 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.669042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2414  Protein of unknown function DUF2183  27.15 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4163  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  hitchhiker  0.000000516956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5817  hypothetical protein  34.84 
 
 
336 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.281836  normal  0.0125997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1700  hypothetical protein  27.46 
 
 
347 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.174731  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0983  hypothetical protein  33.53 
 
 
446 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0844103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0180  hypothetical protein  28 
 
 
399 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0457  hypothetical protein  39.51 
 
 
319 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340218  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1698  hypothetical protein  26.53 
 
 
359 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0054  hypothetical protein  30.84 
 
 
363 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3444  hypothetical protein  24.24 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4841  hypothetical protein  24.75 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00605  actin cytoskeleton organization protein App1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10890)  29.12 
 
 
1058 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1679  hypothetical protein  24.84 
 
 
408 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237936  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07330  hypothetical protein  28.32 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2742  hypothetical protein  31.28 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04410  hypothetical protein  28.81 
 
 
406 aa  92.8  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0365  hypothetical protein  35.15 
 
 
377 aa  92.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0301  hypothetical protein  31.82 
 
 
490 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.362818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00360  hypothetical protein  25.83 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.973936  normal  0.426065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1662  hypothetical protein  34.25 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01130  hypothetical protein  26.37 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70016  predicted protein  31.61 
 
 
638 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.165048  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2101  hypothetical protein  29.41 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10714  actin filament organization protein App1-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06650)  28.71 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  24 
 
 
734 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  23.86 
 
 
754 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  23.86 
 
 
754 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>