42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1905 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1905  Protein of unknown function DUF2183  100 
 
 
400 aa  780    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.607863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4841  hypothetical protein  52.68 
 
 
360 aa  318  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00360  hypothetical protein  48.72 
 
 
415 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.973936  normal  0.426065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1679  hypothetical protein  49.09 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237936  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1700  hypothetical protein  47.9 
 
 
347 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.174731  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1698  hypothetical protein  45.28 
 
 
359 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01130  hypothetical protein  49.56 
 
 
355 aa  290  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0180  hypothetical protein  41.73 
 
 
399 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3444  hypothetical protein  48.05 
 
 
368 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07330  hypothetical protein  50.96 
 
 
368 aa  279  7e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04410  hypothetical protein  42.55 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0054  hypothetical protein  44.25 
 
 
363 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2414  Protein of unknown function DUF2183  38.53 
 
 
352 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2101  hypothetical protein  42.65 
 
 
415 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0983  hypothetical protein  33.14 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0844103  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0301  hypothetical protein  34.47 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.362818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0459  hypothetical protein  33.05 
 
 
364 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3789  hypothetical protein  33.05 
 
 
430 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4838  Protein of unknown function DUF2183  31.14 
 
 
440 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0844  hypothetical protein  33.92 
 
 
429 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00683683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2843  hypothetical protein  33.12 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4397  Protein of unknown function DUF2183  36.4 
 
 
271 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05945  hypothetical protein  23.93 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3505  hypothetical protein  30.77 
 
 
432 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.030263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0205  hypothetical protein  30.52 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2956  hypothetical protein  29.68 
 
 
398 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4889  Protein of unknown function DUF2183  28.33 
 
 
382 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5817  hypothetical protein  29.97 
 
 
336 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.281836  normal  0.0125997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0457  hypothetical protein  30.33 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340218  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4163  hypothetical protein  22.51 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  hitchhiker  0.000000516956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3155  Protein of unknown function DUF2183  27.91 
 
 
357 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1861  hypothetical protein  27.04 
 
 
320 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.669042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2742  hypothetical protein  25.98 
 
 
345 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1662  hypothetical protein  36.97 
 
 
373 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 
734 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00605  actin cytoskeleton organization protein App1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10890)  25.43 
 
 
1058 aa  80.5  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10714  actin filament organization protein App1-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06650)  33.89 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0365  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70016  predicted protein  23.48 
 
 
638 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.165048  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3222  hypothetical protein  35.42 
 
 
127 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>