38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0365 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  781    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1662  hypothetical protein  41.75 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00605  actin cytoskeleton organization protein App1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10890)  35.22 
 
 		 1058 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70016  predicted protein  33.74 
 
 		 638 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.165048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4397  Protein of unknown function DUF2183  35.75 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2843  hypothetical protein  36.21 
 
 		 338 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0205  hypothetical protein  34.8 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0459  hypothetical protein  36.9 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10714  actin filament organization protein App1-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06650)  25 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4838  Protein of unknown function DUF2183  32.51 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4889  Protein of unknown function DUF2183  37.5 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05945  hypothetical protein  35.15 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3155  Protein of unknown function DUF2183  29.67 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0844  hypothetical protein  32.99 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3789  hypothetical protein  38.61 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5817  hypothetical protein  37.65 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.281836  normal  0.0125997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0457  hypothetical protein  27.57 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2742  hypothetical protein  27.61 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0301  hypothetical protein  31.7 
 
 		 490 aa  82.8  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.362818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1861  hypothetical protein  25.3 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.669042  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0983  hypothetical protein  30.86 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0844103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2956  hypothetical protein  32.93 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2414  Protein of unknown function DUF2183  34.19 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0054  hypothetical protein  33.73 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3505  hypothetical protein  32.28 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.030263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4163  hypothetical protein  33.13 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  hitchhiker  0.000000516956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1679  hypothetical protein  28.63 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237936  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4841  hypothetical protein  31.29 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1700  hypothetical protein  31.29 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.174731  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1698  hypothetical protein  32.69 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04410  hypothetical protein  27.56 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1905  Protein of unknown function DUF2183  28.21 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.607863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0180  hypothetical protein  26.37 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3444  hypothetical protein  29.11 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01130  hypothetical protein  28.21 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07330  hypothetical protein  26.83 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00360  hypothetical protein  25.15 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.973936  normal  0.426065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2101  hypothetical protein  25.95 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>