14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1453 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  324  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  29.55 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  28.72 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  31.3 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  32.35 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  30.28 
 
 
145 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  30.23 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  27.61 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  28.75 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  25.83 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  23.89 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  24.78 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>