15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0220 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  89.08 
 
 		 132 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  47.48 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  40.62 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  39.44 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  39.44 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0092  hypothetical protein  33.06 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  27.1 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  25.88 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  26.83 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  35.9 
 
 		 194 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  39.22 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  26.17 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>