15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0191 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  269  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  85.61 
 
 
132 aa  219  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  46.97 
 
 
145 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  42.31 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  41.91 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  39.68 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0092  hypothetical protein  33.86 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  38.96 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  26.32 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  25.2 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  25.57 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  32.74 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  37.88 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>