14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0271 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  67.4 
 
 
180 aa  239  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  56.28 
 
 
184 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  51.34 
 
 
196 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  51.06 
 
 
217 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  48.34 
 
 
198 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  51.52 
 
 
194 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  32.17 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  28.14 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  28.74 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  28.92 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  30.86 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  39.22 
 
 
132 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>