14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0917 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  67.68 
 
 		 217 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  67.01 
 
 		 196 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  54.17 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  54.21 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  51.22 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  49.32 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  30.86 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  30.86 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  26.74 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  32.35 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  29.09 
 
 		 152 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  37.84 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  40.68 
 
 		 132 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.852232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>