15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0313 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  309  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  68.46 
 
 
152 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0092  hypothetical protein  49.62 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  44.26 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  41.67 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  30.51 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  29.94 
 
 
196 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  30.13 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  29.34 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  30.43 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  31.09 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  32.12 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  23.08 
 
 
198 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>