15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4819 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  59.66 
 
 		 196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  59.41 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  60.62 
 
 		 194 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0271  hypothetical protein  50.29 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  47 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  43.75 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1453  hypothetical protein  27.61 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  23.08 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  35.87 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  23.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  26.86 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  45.1 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  39.66 
 
 		 132 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0092  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>