13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5847 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  58.69 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  58.69 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  49.75 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  47.34 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  44.24 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  40.85 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  44.44 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  37.34 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3341  hypothetical protein  41.8 
 
 		 184 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  35.82 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  30.53 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  27.85 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>