13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5239 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  58.69 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  51.44 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  50.97 
 
 
231 aa  204  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  50.24 
 
 
216 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  36.11 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  37.58 
 
 
209 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  39.47 
 
 
224 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3341  hypothetical protein  40.52 
 
 
184 aa  88.2  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  32.82 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  24.24 
 
 
216 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>