12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0937 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  450  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  32.14 
 
 
270 aa  85.9  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  27.32 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  27.85 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  27.17 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  25.89 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  29.93 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  24.24 
 
 
229 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  24.24 
 
 
229 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  33.08 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  28.79 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  25.53 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>