13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5035 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  57.28 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  57.75 
 
 		 216 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  50.97 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  50.97 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  44.24 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  37.33 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  37.66 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3341  hypothetical protein  42.62 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  39.06 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  31.18 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  31.29 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  27.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>