14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1627 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  37.34 
 
 
218 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  35 
 
 
216 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  37.58 
 
 
229 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  37.58 
 
 
229 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  36.84 
 
 
222 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  37.66 
 
 
231 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  39.69 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3341  hypothetical protein  33.77 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  34.39 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  30.67 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  33.53 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  28.79 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  28.69 
 
 
902 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>