13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2692 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  37.01 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  35.82 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  31.29 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  34.57 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  32.56 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  32.84 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  32.84 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  30.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  27.59 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3341  hypothetical protein  30.36 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>