14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0268 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0268  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5847  hypothetical protein  40.85 
 
 
218 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5239  hypothetical protein  36.11 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5620  hypothetical protein  36.11 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0878331  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0717  hypothetical protein  38.82 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5035  hypothetical protein  37.33 
 
 
231 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3384  hypothetical protein  36.02 
 
 
228 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1627  hypothetical protein  36.84 
 
 
209 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170719  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5147  hypothetical protein  36.84 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.688934 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3341  hypothetical protein  38.64 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2692  hypothetical protein  36 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1013  hypothetical protein  31.82 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2007  hypothetical protein  41.86 
 
 
108 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.114033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0937  hypothetical protein  29.93 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>