51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3272 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3272  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0628672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4232  polyketide biosynthesis O-methyltransferase-like protein  54.37 
 
 
295 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0401297  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1502  tetracenomycin polyketide synthesis O-methyltransferase TcmP, putative  26.34 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0223553  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0673  O-methyltransferase domain protein  27.97 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3118  O-methyltransferase domain-containing protein  29.28 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5704  O-methyltransferase domain-containing protein  29.06 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1104  O-methyltransferase domain protein  30.54 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.155822  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5467  O-methyltransferase domain-containing protein  29.79 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17950  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  27.65 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2110  O-methyltransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
289 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3430  hypothetical protein  29.02 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5088  O-methyltransferase-like protein  28.33 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5176  O-methyltransferase domain-containing protein  28.33 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40430  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0666  O-methyltransferase domain-containing protein  29.52 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.622962  normal  0.600232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2431  O-methyltransferase domain-containing protein  30 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2437  O-methyltransferase domain-containing protein  22.88 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0246997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3385  O-methyltransferase domain-containing protein  25.57 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2215  O-methyltransferase domain-containing protein  25 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17000  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  26.32 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2871  O-methyltransferase domain-containing protein  27.75 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.818306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2827  O-methyltransferase-like protein  27.75 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2856  O-methyltransferase domain-containing protein  27.75 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11177  O-methyltransferase omt  31.94 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0596  O-methyltransferase domain protein  23.75 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0762  O-methyltransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0849506  normal  0.431199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0979  O-methyltransferase domain-containing protein  34.09 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0412  O-methyltransferase domain protein  31.03 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1898  O-methyltransferase domain-containing protein  26.22 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4367  polyketide biosynthesis O-methyltransferase-like protein  32.31 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948033  normal  0.100702 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23900  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  28.65 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0623089  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4135  O-methyltransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4060  O-methyltransferase-like protein  32.84 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4289  O-methyltransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0340  putative O-methyltransferase  29.41 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023288  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2136  O-methyltransferase domain-containing protein  28.81 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00267  O-methyltransferase  27.19 
 
 
266 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5259  O-methyltransferase domain-containing protein  30.15 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2892  hypothetical protein  26.98 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0641  Na(+)/H(+) antiporter 1 (Sodium/proton antiporter 1)  21.84 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002150  O-methyltransferase-related protein  25.58 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1692  O-methyltransferase-like  24.43 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616976  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2424  hypothetical protein  26.74 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5320  O-methyltransferase domain-containing protein  28.03 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5232  O-methyltransferase-like protein  28.03 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0301  tetracenomycin polyketide synthesis O-methyltransferase TcmP, putative  24.53 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.375347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3064  polyketide biosynthesis O-methyltransferase-like protein  28.4 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857164  normal  0.130558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5612  O-methyltransferase domain-containing protein  28.03 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.41863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4568  O-methyltransferase domain-containing protein  26.92 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  29.71 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3107  O-methyltransferase domain-containing protein  29.17 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>