41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2424 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2424  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  600  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002150  O-methyltransferase-related protein  61.98 
 
 
264 aa  351  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00267  O-methyltransferase  61.89 
 
 
266 aa  348  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2892  hypothetical protein  52.47 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0596  O-methyltransferase domain protein  22.39 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1502  tetracenomycin polyketide synthesis O-methyltransferase TcmP, putative  23.28 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0223553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2437  O-methyltransferase domain-containing protein  20 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0246997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1898  O-methyltransferase domain-containing protein  30.19 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2215  O-methyltransferase domain-containing protein  26.02 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2431  O-methyltransferase domain-containing protein  29.55 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0340  putative O-methyltransferase  24.14 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023288  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5467  O-methyltransferase domain-containing protein  26.44 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3118  O-methyltransferase domain-containing protein  30.38 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40430  hypothetical protein  26.59 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1692  O-methyltransferase-like  20.3 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616976  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0673  O-methyltransferase domain protein  22.91 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2856  O-methyltransferase domain-containing protein  29.57 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17950  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  28.91 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3430  hypothetical protein  25.43 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0666  O-methyltransferase domain-containing protein  27.94 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.622962  normal  0.600232 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2110  O-methyltransferase domain-containing protein  26.45 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2871  O-methyltransferase domain-containing protein  28.7 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.818306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2827  O-methyltransferase-like protein  28.7 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23900  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  28.83 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0623089  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5176  O-methyltransferase domain-containing protein  25.44 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5088  O-methyltransferase-like protein  25.44 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1104  O-methyltransferase domain protein  26.51 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.155822  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3107  O-methyltransferase domain-containing protein  27.35 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3272  hypothetical protein  26.74 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0628672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0301  tetracenomycin polyketide synthesis O-methyltransferase TcmP, putative  18.6 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.375347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5704  O-methyltransferase domain-containing protein  25.62 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152197  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17000  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  29.59 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4568  O-methyltransferase domain-containing protein  26.4 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3385  O-methyltransferase domain-containing protein  22.99 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4060  O-methyltransferase-like protein  24.71 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3375  O-methyltransferase domain-containing protein  26.09 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4135  O-methyltransferase domain-containing protein  24.71 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2136  O-methyltransferase domain-containing protein  24.65 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0412  O-methyltransferase domain protein  25.41 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4289  O-methyltransferase domain-containing protein  24.12 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4367  polyketide biosynthesis O-methyltransferase-like protein  29.17 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948033  normal  0.100702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>