41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2888 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0188  hypothetical protein  51.12 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0411  hypothetical protein  45.1 
 
 		 207 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0317  hypothetical protein  49.16 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0136  hypothetical protein  46.77 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0750  hypothetical protein  44.5 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.209487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0726  hypothetical protein  46.11 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0725  hypothetical protein  49.44 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2870  hypothetical protein  53.29 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1569  hypothetical protein  46.15 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1352  hypothetical protein  56.55 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15710  hypothetical protein  56.13 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000018082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1110  hypothetical protein  47.49 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  0.278703 
 
 
-
 
NC_003296  RS03158  hypothetical protein  47.12 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4280  hypothetical protein  46.99 
 
 		 204 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4168  hypothetical protein  46.99 
 
 		 204 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1429  hypothetical protein  58.78 
 
 		 233 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1460  hypothetical protein  59.09 
 
 		 235 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0633  hypothetical protein  58.78 
 
 		 234 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.465326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3057  hypothetical protein  58.78 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1563  hypothetical protein  58.78 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0519  hypothetical protein  58.78 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1234  hypothetical protein  58.78 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2819  hypothetical protein  48.21 
 
 		 285 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0226  hypothetical protein  47.57 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.0000211885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0944  hypothetical protein  41.38 
 
 		 225 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2823  conserved hypothetical cytosolic protein  44.04 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0218  hypothetical protein  46.96 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2058  hypothetical protein  49.71 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0280  hypothetical protein  40.98 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  hitchhiker  0.000454163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3398  hypothetical protein  44.21 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2807  hypothetical protein  41.36 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0299  hypothetical protein  41.36 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0036  hypothetical protein  43.27 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1037  hypothetical protein  41.38 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0203  hypothetical protein  43.41 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847024  unclonable  0.00000000000631089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2169  hypothetical protein  50.86 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.972092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4058  hypothetical protein  51.3 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1688  hypothetical protein  45 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.918943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3257  hypothetical protein  46.24 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.240926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5935  hypothetical protein  33.51 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0497798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>