41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0317 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0317  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0188  hypothetical protein  67.57 
 
 
193 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1569  hypothetical protein  59.07 
 
 
198 aa  214  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3398  hypothetical protein  60.41 
 
 
208 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0218  hypothetical protein  60.54 
 
 
210 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0226  hypothetical protein  59.59 
 
 
208 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.0000211885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0280  hypothetical protein  60.32 
 
 
208 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  hitchhiker  0.000454163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0203  hypothetical protein  58.08 
 
 
211 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847024  unclonable  0.00000000000631089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0299  hypothetical protein  57.59 
 
 
210 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2807  hypothetical protein  57.59 
 
 
210 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2819  hypothetical protein  52.91 
 
 
285 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1352  hypothetical protein  54.4 
 
 
195 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0136  hypothetical protein  56.19 
 
 
207 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626724  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15710  hypothetical protein  55.85 
 
 
194 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000018082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3057  hypothetical protein  50.23 
 
 
233 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0519  hypothetical protein  50.23 
 
 
233 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1429  hypothetical protein  50.23 
 
 
233 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1234  hypothetical protein  50.23 
 
 
233 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0633  hypothetical protein  50.23 
 
 
234 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.465326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1563  hypothetical protein  50.23 
 
 
233 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1460  hypothetical protein  50.46 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0411  hypothetical protein  51.02 
 
 
207 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0944  hypothetical protein  51.53 
 
 
225 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4280  hypothetical protein  54.3 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4168  hypothetical protein  54.3 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0750  hypothetical protein  51.81 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.209487  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0725  hypothetical protein  53.76 
 
 
192 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2823  conserved hypothetical cytosolic protein  47.96 
 
 
223 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1110  hypothetical protein  55.49 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  0.278703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0036  hypothetical protein  50.78 
 
 
220 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0726  hypothetical protein  51.34 
 
 
203 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_003296  RS03158  hypothetical protein  52.97 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1037  hypothetical protein  46.28 
 
 
194 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2888  hypothetical protein  47.19 
 
 
191 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2058  hypothetical protein  49.19 
 
 
201 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1688  hypothetical protein  47.62 
 
 
208 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.918943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4058  hypothetical protein  52.15 
 
 
229 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842378  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3257  hypothetical protein  53.23 
 
 
191 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.240926  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2169  hypothetical protein  50.27 
 
 
194 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.972092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2870  hypothetical protein  43.01 
 
 
206 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248632  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5935  hypothetical protein  36.18 
 
 
205 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0497798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>