41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0188 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0317  hypothetical protein  67.57 
 
 		 190 aa  244  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1569  hypothetical protein  58.85 
 
 		 198 aa  221  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3398  hypothetical protein  64.36 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0226  hypothetical protein  63.83 
 
 		 208 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.0000211885 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0299  hypothetical protein  63.16 
 
 		 210 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2807  hypothetical protein  63.16 
 
 		 210 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0280  hypothetical protein  64.89 
 
 		 208 aa  217  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  hitchhiker  0.000454163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0203  hypothetical protein  63.16 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847024  unclonable  0.00000000000631089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0218  hypothetical protein  65.22 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2819  hypothetical protein  55.5 
 
 		 285 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1352  hypothetical protein  57.59 
 
 		 195 aa  207  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0944  hypothetical protein  54.41 
 
 		 225 aa  207  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15710  hypothetical protein  59.56 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000018082 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0633  hypothetical protein  54.46 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.465326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3057  hypothetical protein  54.46 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0519  hypothetical protein  54.46 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1460  hypothetical protein  54.46 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1234  hypothetical protein  54.46 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1563  hypothetical protein  54.46 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1429  hypothetical protein  54.46 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0411  hypothetical protein  54.27 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0750  hypothetical protein  55.05 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.209487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0136  hypothetical protein  56.78 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4280  hypothetical protein  52.82 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4168  hypothetical protein  52.82 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0725  hypothetical protein  57.38 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2823  conserved hypothetical cytosolic protein  52.31 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1110  hypothetical protein  57.38 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  0.278703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0036  hypothetical protein  50.98 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0726  hypothetical protein  53.48 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_003296  RS03158  hypothetical protein  54.1 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1688  hypothetical protein  51.02 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.918943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2058  hypothetical protein  51.37 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2888  hypothetical protein  49.17 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4058  hypothetical protein  55.38 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3257  hypothetical protein  54.89 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.240926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2169  hypothetical protein  51.89 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.972092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1037  hypothetical protein  42.63 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2870  hypothetical protein  43.01 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5935  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0497798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>