41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0226 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0226  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.0000211885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0218  hypothetical protein  93.27 
 
 
210 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3398  hypothetical protein  89.42 
 
 
208 aa  344  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2807  hypothetical protein  88.1 
 
 
210 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0299  hypothetical protein  88.1 
 
 
210 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0280  hypothetical protein  88.94 
 
 
208 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  hitchhiker  0.000454163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0203  hypothetical protein  81.04 
 
 
211 aa  334  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847024  unclonable  0.00000000000631089 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2819  hypothetical protein  66.83 
 
 
285 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1569  hypothetical protein  65.62 
 
 
198 aa  244  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0633  hypothetical protein  60.44 
 
 
234 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.465326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0519  hypothetical protein  60.81 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1460  hypothetical protein  61.19 
 
 
235 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1429  hypothetical protein  60.81 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1234  hypothetical protein  60.81 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1563  hypothetical protein  60.81 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3057  hypothetical protein  60.81 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0188  hypothetical protein  64.21 
 
 
193 aa  223  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1352  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15710  hypothetical protein  58.88 
 
 
194 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000018082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0317  hypothetical protein  61.26 
 
 
190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0944  hypothetical protein  59.3 
 
 
225 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0411  hypothetical protein  56.99 
 
 
207 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0136  hypothetical protein  56.92 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626724  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2823  conserved hypothetical cytosolic protein  54.55 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0036  hypothetical protein  54.63 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4280  hypothetical protein  53.47 
 
 
204 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4168  hypothetical protein  53.47 
 
 
204 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0750  hypothetical protein  55.38 
 
 
201 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.209487  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03158  hypothetical protein  55.38 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1110  hypothetical protein  55.08 
 
 
193 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  0.278703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1688  hypothetical protein  52.28 
 
 
208 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.918943  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1037  hypothetical protein  48.68 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0726  hypothetical protein  50.74 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2058  hypothetical protein  52.71 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0725  hypothetical protein  53.93 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4058  hypothetical protein  55.32 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842378  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2169  hypothetical protein  51.49 
 
 
194 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.972092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3257  hypothetical protein  50.26 
 
 
191 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.240926  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2870  hypothetical protein  44.5 
 
 
206 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248632  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2888  hypothetical protein  44.97 
 
 
191 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5935  hypothetical protein  44.33 
 
 
205 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0497798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>