18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04797 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04797  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  24.55 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  24.46 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  25.09 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  29.73 
 
 
217 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  29.73 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  22.97 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  35.06 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  30.84 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  30.84 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  24.76 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  30.84 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  30.84 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  30.84 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  30.84 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  30.84 
 
 
223 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  23.13 
 
 
365 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>