54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00058 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  46.48 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  34.69 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  37.89 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  37.76 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  41.03 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.89 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.84 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  36.84 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  34.74 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2770  hypothetical protein  37.36 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000417005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  36.96 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  36.73 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  36.36 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.68 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  32.32 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  34.38 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.68 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  44.44 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.65 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.56 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  33.33 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0514  sulfur relay protein TusB/DsrH  41.03 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00166846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.41 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.61 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  32.65 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  34.09 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  35.71 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  34.52 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0435  hypothetical protein  34.52 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  35.87 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  32.94 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  29.9 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  29.9 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.03 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  30.93 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>