62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3624 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  96.84 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  96.84 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  96.84 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  96.84 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  96.84 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  95.79 
 
 		 95 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  94.74 
 
 		 95 aa  181  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  93.68 
 
 		 95 aa  179  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  66.32 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  65.26 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  65.26 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  65.26 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  65.26 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  58.95 
 
 		 95 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  61.05 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  54.74 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  52.63 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  48.42 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  48.42 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  47.37 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  47.37 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  47.37 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  43.16 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.17 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  40 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  36.56 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  39.13 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  37.37 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.37 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.63 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  34.69 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  38.78 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  36.17 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.95 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  38.14 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  37.11 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  36.46 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  36.46 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  32.98 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  36.46 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  35.42 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.05 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  36.08 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.38 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  32.29 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  34.38 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  36.49 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  32.67 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  31.58 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.29 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  32.29 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  32.29 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  32.29 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  33.67 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0514  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.97 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00166846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  33.67 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  31.37 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  29.21 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  40.48 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>