51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1955 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  100 
 
 		 99 aa  203  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  54.55 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  53.47 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  44 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  44 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  46.24 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  50 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  44.09 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  45 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  44 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  41 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  43.43 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  39.39 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  42.42 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  40 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  40.4 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  42 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  42 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  42 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  42 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  42 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  42 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  41 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  42 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.38 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  40 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  40.4 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  37.37 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  38.38 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  37.37 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  36.36 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  37 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  38 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  34.34 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  34.34 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  34.34 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  30.3 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  38 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  35 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  35 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  35 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  33 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0435  hypothetical protein  35.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  36.27 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  36.27 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  32.32 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  35.35 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  32.31 
 
 		 61 aa  40  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>