34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0309 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  197  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  37.89 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.62 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.14 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  33 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  36 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2770  hypothetical protein  34.74 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000417005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.14 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  35.14 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  32.05 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  36.49 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  35.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  35.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  35.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  35.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  35.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  35.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  36.07 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  30.14 
 
 		 95 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  28.21 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  28.21 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  34.04 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  32.26 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  32.26 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  28.71 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.88 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  31.17 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  31.17 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  31.17 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  31.17 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  31.17 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  28.21 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>