55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3831 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  100 
 
 
95 aa  193  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  85.26 
 
 
95 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  60 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  60 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  52.63 
 
 
95 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  49.47 
 
 
95 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  51.58 
 
 
95 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  53.68 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  52.63 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  52.63 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  50.53 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  50.53 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  50.53 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  50.53 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  50.53 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  50.53 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  48.42 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  48.42 
 
 
95 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  48.42 
 
 
95 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  50.53 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  48.42 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  48.42 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  47.37 
 
 
95 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  42.11 
 
 
95 aa  84  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.37 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  37.76 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.41 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  40.4 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  40.4 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.04 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.78 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  33.67 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  37.37 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  35.71 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  33.68 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.67 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  37.5 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.5 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.38 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  37.5 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  37.5 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  37.5 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  35.42 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  35.42 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  32.32 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  34.38 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  30.43 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  35.05 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  29.79 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1633  hypothetical protein  37 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  35.42 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  29.13 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  32.88 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>