31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002296 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  68.85 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  45.24 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  45.83 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2770  hypothetical protein  48.78 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000417005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  41.86 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  36.07 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.71 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  35.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  44.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  32.81 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  32.81 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  40.48 
 
 		 95 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  37.21 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  36.51 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.1 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  40.48 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  38.64 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  32.31 
 
 		 99 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>