49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  65.66 
 
 		 99 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  60.61 
 
 		 99 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  61.62 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  56.57 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  59.6 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  60.61 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  53.54 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  51.52 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  51.52 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  54.55 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.08 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  41 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  37.11 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  40.62 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.05 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  31.96 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.02 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.29 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.46 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  36.46 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  36.46 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  36.46 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000315434  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  36.08 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  31.63 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  35.42 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  34.38 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000589995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  34.38 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  35.35 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2347  putative sulfur oxidation protein DsrH  26.53 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  32.94 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000040872  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000702731  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  32.29 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  32.29 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  32.29 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  31.68 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.65 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  31.63 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>