55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3340 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  78.79 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  66.67 
 
 		 99 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  60.61 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  60.61 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  57.58 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  54.08 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  53.4 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  53.4 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  54.08 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  54.46 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  40 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.02 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.02 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  31.96 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  38.14 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.66 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.46 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  40.95 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.96 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  36.36 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  36.46 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  35.71 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  29.9 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  32.99 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  37.5 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  36.84 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  33.33 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  30.69 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  38.54 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  34 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  37.5 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  37.5 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  37.5 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  39.58 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  39.58 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  39.58 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  39.58 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  36.73 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  36.73 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  33.33 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  39.58 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  36.73 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2347  putative sulfur oxidation protein DsrH  28.57 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  29.9 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  32.99 
 
 		 95 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000156644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  32.99 
 
 		 95 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000136461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  32.99 
 
 		 95 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000044476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  32.99 
 
 		 95 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  32.99 
 
 		 95 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.0769099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  32.99 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000023417  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  32.99 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000150284  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.99 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>