37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1801 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  60.78 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  59.8 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  59.8 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  59.8 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  59.8 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  59.8 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  57.84 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  57.84 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  57.84 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  53.92 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  50.98 
 
 		 93 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  48.04 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  48.04 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  48.68 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  40.95 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  36.19 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  35.24 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.24 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.25 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  35.24 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  35.24 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  37.86 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  36.19 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  36.19 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.24 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  30.19 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  28.3 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.79 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  27.36 
 
 		 99 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  32.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  36.36 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  29.25 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>