13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2612 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2612  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  265  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0108  hypothetical protein  76.61 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.930749  normal  0.0145062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4094  capsule biosynthesis phosphatase  72 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3890  capsule biosynthesis phosphatase  71.2 
 
 		 133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1802  capsule biosynthesis phosphatase  58.54 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0731  hypothetical protein  57.63 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0422  hypothetical protein  48.36 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1662  hypothetical protein  50.85 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0300  capsular polysaccharide biosynthesis protein  65.28 
 
 		 81 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0248181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1341  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase-like  33 
 
 		 347 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00519164  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1331  hypothetical protein  27.83 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0108039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1347  phosphoheptose isomerase  30.69 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.19661  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  28.57 
 
 		 269 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>