12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0422 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0731  hypothetical protein  63.41 
 
 		 132 aa  180  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2612  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0108  hypothetical protein  50.82 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.930749  normal  0.0145062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1662  hypothetical protein  49.15 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3890  capsule biosynthesis phosphatase  46.34 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4094  capsule biosynthesis phosphatase  46.34 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875104 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1802  capsule biosynthesis phosphatase  45.9 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0300  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.67 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0248181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1331  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0108039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1341  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase-like  33.94 
 
 		 347 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00519164  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1347  phosphoheptose isomerase  31.78 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.19661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>